El siguiente esquema resume la organización interna del Instituto Investigaciones Clínicas:

Como puede observarse, el ente rector del Instituto es su Junta Directiva, que esta compuesta por el director del Instituto, un representante de la dirección Médica de la Fundación Valle del Lili, un representante de la dirección administrativa, un representante del comité de ética y un representante del comité de Investigaciones.

Reportando directamente al director del Instituto se encuentran las cuatro áreas básicas, responsables de la logística y el funcionamiento interno.

Es pues para nosotros un enorme privilegio el poder presentar a todo el personal de la Fundación, a la comunidad científica y al país, este nuevo INSTITUTO DE INVESTIGACIONES CLINICAS, que sin duda alguna, será una de las bases sobre las cuales se cimiente el desarrollo sostenible de la Fundación Valle del Lili.